①預防或改善腹瀉：飲食習慣不良或服用抗生素均會打破腸道菌群平衡，從而導致腹瀉。補充益生菌有助于平衡腸道菌群及恢復正常的腸道pH值，緩解腹瀉癥狀。
②緩解不耐乳糖癥狀：乳桿菌可幫助人體分解乳糖，緩解腹瀉、脹氣等不適癥狀，可與牛奶同食。
③預防陰道感染：酸牛奶中的嗜酸乳桿菌可抑制陰道內白色念珠菌的繁殖。歐洲所做的雙盲對照試驗證實了這一點。女病人每人每日口服150毫升含大量益生菌的酸牛奶，結果陰道感染發生率大大低于安慰劑組婦女。
④增強人體免疫力：在腸道內存在著非常發達的免疫系統。益生菌可以通過刺激腸道內的免疫機能，將過低或過高的免疫活性調節至正常狀態。益生菌這種免疫調節的作用也被認為有助于抗癌與抑制過敏性疾病。
⑤促進腸道消化系統健康：益生菌可以抑制有害菌在腸內的繁殖，減少毒素，促進腸道蠕動，從而提高腸道機能，改善排便狀況。
⑥降低血清膽固醇：歐洲的高加索山區、地中海沿岸是著名的長壽之鄉，當地人常飲自制的酸牛奶，極少患糖尿病、心血管病及肥胖癥，大量科學研究證實這與酸牛奶中富含益生菌有關。這些益生菌可降低血清膽固醇水平，此外，長期補充益生菌的還有助于防止骨質丟失，預防骨質疏松癥。
病人經常服用含益生菌的保健食品，可預防與治療腹瀉癥。正常人體腸道內棲息著500多種、數十萬億個不同的細菌，它們在絕大多數情況下是互相制約、共存共榮的。一旦腸道菌叢平衡被打破，就會引起腹瀉。其次，濫用抗生素也會引起腹瀉。歐洲一些醫療中心試用以乳桿菌、雙歧桿菌與菊糖為主要成分的口服液治療旅行者腹瀉，也取得良好效果。
益生菌的另一作用是，可預防陰道感染癥。歐洲所做的雙盲對照試驗（46名有陰道霉菌感染史的婦女參加了試驗）證實了這一點。女病人每人每日口服150毫升含大量益生菌的酸牛奶，結果陰道感染發生率大大低于安慰劑組婦女。這是因為酸牛奶中的嗜酸乳桿菌可抑制陰道內白色念珠菌的繁殖。
科學家認為：益生菌在腸道內的大量繁衍可促進并提高人體的全身免疫能力。在歐洲一些著名長壽之鄉（如高加索山區、地中海沿岸國家），當地人常飲自制的酸牛奶，極少患糖尿病、心血管病、肥胖癥，研究認為這與酸牛奶中含大量益生菌有關從70年代到90年代，國外所做的大量試驗證實：喝益生菌飲料確實可降低血清膽固醇。最近國外又有學者發表論文指出：每天喝200毫升加入嗜酸乳桿菌以及菊糖后發酵的酸牛奶，可使高脂血癥患者的血脂平均下降4.4％左右。因為嗜酸乳桿菌與菊糖兩者均有降脂作用。
